1943: Naissance du Football Club de Nantes. Sous l'impulsion de Marcel Saupin, président de la Mellinet, cinq clubs nantais fusionnent. La Saint-Pierre, le Stade Nantais U.C., l' A.C. Batignolles, l'A.S.O. Nantaise et la Mellinet unissent leur force suivant le mot d'ordre de Saupin : « Petite équipe aujourd'hui, elle sera grande un jour si nous œuvrons ensemble. » Les couleurs jaune et verte sont choisies en référence à celles de l'écurie de chevaux de course de Jean Le Guillou, un des fondateurs du club. La Saint-Pierre de Nantes, venant de se classer en Division d'Honneur de la Ligue de l'Ouest cède alors sa place au FC Nantes.

1945: Coupe de l'Ouest. Champion de l'Ouest. Montée en Division 2 de la zone nord. Le premier match du FC Nantes en tant que professionnel se joue au Stade Olympique de Colombes, contre le C.A. Paris et une victoire 2-0. Le club termine 5^e pour cette première saison.